Mudanças entre as edições de "Plataforma Alelo Recursos Genéticos"

Edição das 17h07min de 19 de novembro de 2021

Apresentação

A Plataforma Alelo Recursos Genéticos é uma plataforma de serviços de tecnologia da informação (TI), de base Web, dedicada às atividades de pesquisa em conservação e enriquecimento de recursos genéticos (RG) desenvolvida pela Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa). A Plataforma Alelo é formada pela infraestrutura de informática (hardware); bases de dados e sistemas de tecnologia da informação (softwares); processos e serviços dedicados à gestão, treinamento e apoio à documentação de dados e informações (peopleware) das atividades desenvolvidas em núcleos de criação (animal), coleções biológicas (microrganismos), coleções e bancos de germoplasma (vegetal) com foco no tema RG.

Portal da Plataforma Alelo Recursos Genéticos (http://alelo.cenargen.embrapa.br/)

Cada vertente temática (animal, microrganismo e vegetal) possui conjunto próprio de recursos de TI, modelados exclusivamente para apoiar as atividades desenvolvidas no âmbito de suas coleções, disponíveis no portal da Plataforma.

Animal

O Sistema de gestão de dados e informações de recursos genéticos da vertente animal foi concebido com a participação de equipes do Brasil, Canadá e Estados Unidos da América (EUA), por meio das respectivas empresas estatais de pesquisa: Brasil: Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa); EUA: Agriculture Research Service (ARS); e Canadá: Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC). Além do sistema de gestão, a vertente animal possui sistema de consulta pública e sítios de apresentação de números gerais da vertente e da Supervisão da Curadoria de RG Animal, com lista de núcleos de criação formalizado, nome e contato dos respectivos curadores/especialistas.

Microrganismos

O sistema AleloMicro é o sistema especializado na gestão de dados de informações de recursos genéticos microbianos. Além do AleloMicro dedicado à gestão, a Vertente Microbiana possui sistemas de busca e consulta pública; sítio de apresentação de números gerais e da Supervisão de Curadoria de Microrganismos da Embrapa, com relação das coleções biológicas e respectivos curadores/especialistas; glossário, manual e tutoriais de apoio aos usuários no espaço AleloWiki.

Vegetal

O sistema AleloVegetal é o sistema especializado na gestão de recursos genéticos vegetais. O sistema possui módulos avançados de documentação e gestão das atividades de conservação desenvolvidas em coleções e bancos de Germoplasma vegetal. O sistema foi denominado inicialmente Acessar, durante o período de migração assistida de dados remanescentes do Sibrargen e de outras bases de dados ainda disponíveis nas atividades de curadorias de recursos genéticos da Embrapa. Atualmente, com apoio do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA), O AleloVegetal vem ampliando seu escopo de usuários por meio de parcerias com outras instituições acadêmicas e de pesquisa que atuam no tema RG vegetal. A vertente vegetal possui ainda sistema de busca e consulta pública à base de dados de RG vegetal; sítios de apresentação de números gerais e da Supervisão de Curadoria Vegetal com relação das coleções formalizadas, além de glossário de termos, legislação aplicada, manuais e tutoriais de apoio disponíveis no Espaço AleloWiki.

Breve história da Plataforma

A Embrapa, no cumprimento de sua missão institucional, de fazer pesquisa e levar alimento de qualidade à mesa dos brasileiros, buscou dotar sua equipe de pesquisadores de recursos e ferramentas necessárias ao desenvolvimento da Pesquisa. Desde a década de 80 a empresa se utiliza de ferramentas de informação no manejo de dados de recursos genéticos. No processo de atualização tecnológica, a Embrapa tem incorporado novos recursos da área de tecnologia da informação voltados à gestão de recursos genéticos da área animal, vegetal e de microrganismos.

A Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, uma de suas unidades descentralizadas (UD), criada em 1974, foi pioneira no Brasil no uso da tecnologia da informação para a gestão de coleções vegetais com o desenvolvimento do Sistema de Informações de Recursos Genéticos (SIRG). No início dos anos 90, o SIRG operou com um conjunto de aplicativos standAlone (sem uso de redes) para microcomputadores. Este foi substituído em 2000 com a adaptação do Genetic Resource Information Network (GRIN), a partir de uma parceria da Embrapa com o Departamento de Agricultura dos EUA (United States Department of Agriculture – USDA). A versão brasileira, denominada Sistema Brasileiro de Informação de Recursos Genéticos (Sibrargen) passou a utilizar o modelo de arquitetura cliente-servidor com base de dados centralizada.

A partir de 2010, a Plataforma Nacional de Recursos Genéticos, concebida para organizar o sistema de curadorias da Embrapa, passou por reformulação e ações estratégicas foram criadas para apoiar as atividades de conservação e gestão de recursos genéticos. O projeto de documentação e informatização de Recursos Genéticos foi aprovado no âmbito do Macroprograma I (Sistema Embrapa de Gestão), permitindo o desenvolvimento do sistema AleloVegetal, em substituição ao Sibrargen, com tecnologia Web e código aberto (open source). O sistema AleloVegetal possui recursos de segurança e funcionalidade desde o manejo das informações até a sua disponibilização para a consulta pública, favorecendo o intercâmbio de materiais biológicos e conhecimento entre as coleções de RG. Encontra-se em processo permanente de execução a migração e incorporação do conjunto de informações existentes nas diversas coleções e bancos de germoplasma da Embrapa para a base de dados de Recursos Genéticos da Plataforma Alelo.

Sediada no DataCenter de RG da Embrapa, a Plataforma Alelo Recursos Genéticos veio abrigar o conjunto de sistemas de apoio à gestão das informações produzidas no âmbito dos Recursos Genéticos animal, microrganismo e vegetal, e organizar os demais recursos dedicados ao compartilhamento de documentos, informações sobre legislação, termos de referência, coleções genéticas, área de treinamento, consultas públicas e o Tratado Internacional de Recursos Fitogenéticos para Alimentação e Agricultura (TIRFAA). A Plataforma Alelo foi concebida como um portal de serviços, integrando as diversas UDs da Empresa, por meio da gestão corporativa de dados. O Sistema AleloVegetal, por exemplo, possui função multilínguas e pluri-institucional, com diversos níveis de acesso, garantindo a segurança da informação para diferentes perfis de usuário, desde o curador até o cliente externo. As características e metodologias adotadas no desenvolvimento do AleloVegetal permitem que o sistema seja usado por outras instituições de pesquisa no manejo de dados obtidos nas atividades com recursos genéticos.

O Sistema de gestão de dados de RG Animal, disponível no Plataforma Alelo, foi desenvolvido a partir de parceria entre vários países, por meio de suas empresas estatais de pesquisa: Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa/Brasil), Agriculture Research Service (ARS/EUA), e Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC/Canadá).

A Plataforma Alelo e seu conjunto de sistemas, ferramentas e recursos voltados à gestão de dados e informações de Recursos Genéticos, é fruto do encontro e do empenho de pesquisadores e profissionais de desenvolvimento, e conta com o apoio de parceiros internos e externos, que desde 2010 têm dedicado grande esforço à sua realização. Além da equipe de TI da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, os desafios vencidos até o lançamento da Plataforma Alelo contou com atuação e colaboração da Chefia da Unidade, Macroprograma 1 (Mp1), Departamento de Pesquisa e Desenvolvimento (DPD), Departamento de Tecnologia da Informação (DTI), Secretaria de Relações Internacionais (SRI), Diretoria Executiva (DE), Banco Ativo de Germoplasma (BAG) Arroz e Feijão (CNPAF), Agriculture Research Service (ARS/US), Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC/CA), além de colaboradores externos e profissionais, Curadores e Pesquisadores de diversas unidades descentralizadas da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária – Embrapa.

Informações do projeto da Plataforma Alelo

• Código SEG: 20.20.02.005.00.00: (1/5/2021-31/12/2024); Título: REGEN_02_19 Suporte e continuidade de soluções digitais para recursos genéticos na Plataforma Alelo; Líder: Gilberto de Oliveira Hiragi (gilberto.hiragi@embrapa.br) Analista; Unidade: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecologia;
  • Plano de ação 20.20.02.005.00.01: Solução para Inovação: Gestão do Projeto; Responsável: Gilberto de Oliveira Hiragi;
    • Resultado 1: Capacitação de multiplicadores e/ou curadores dos Núcleos de Conservação da Embrapa e Gestores de Recursos Genéticos animais para uso das novas funcionalidades e manutenções evolutivas do AleloAnimal; tipo de Resultado: Capacitação e atualização tecnológica de agentes multiplicadores;
    • Resultado 2: Capacitação de multiplicadores e/ou curadores de coleções microbianas e Gestores de Recursos Genéticos microbianos para uso das novas funcionalidades e manutenções evolutivas do AleloMicro; tipo de Resultado: Capacitação e atualização tecnológica de agentes multiplicadores;
    • Resultado 3: Capacitação de multiplicadores e/ou curadores de bancos de germoplasma vegetal e Gestores de Recursos Genéticos vegetais para uso das novas funcionalidades e manutenções evolutivas do AleloVegetal; tipo de Resultado: Capacitação e atualização tecnológica de agentes multiplicadores
  • Atividades
    • Código Ativ. 20.20.02.005.00.01.001: Gerenciamento do projeto, visando a continuidade e desenvolvimento da plataforma digital Alelo para processos e dados de Recursos Genéticos; Responsável: Gilberto de Oliveira Hiragi;
    • Código Ativ. 20.20.02.005.00.01.002: Migração, padronização e atualização de bases de dados de Recursos Genéticos na plataforma Alelo; Responsável: Renato Sales dos Santos;
    • Código Ativ. 20.20.02.005.00.01.003: Suporte e atendimento aos usuários das soluções de Tecnologia da Informação da plataforma Alelo; Responsável: Francisco Régis Ferreira Lopes
    • Código Ativ. 20.20.02.005.00.01.004: Gestão da infraestrutura de Hardware e Software que hospeda as soluções de Tecnologia da Informação da plataforma Alelo; Responsável: Ricardo Berlim Fonseca;
    • Código Ativ. 20.20.02.005.00.01.005: Proposição, priorização e acompanhamento de demandas para a plataforma Alelo; Responsável: Samuel Rezende Paiva;
    • Código Ativ. 20.20.02.005.00.01.006: Manutenção corretiva e evolutiva de softwares componentes da plataforma Alelo para vertente Vegetal; Responsável: Leonardo Guedes de Oliveira;
    • Código Ativ. 20.20.02.005.00.01.007: Manutenção corretiva e evolutiva de softwares componentes da plataforma Alelo para vertente Microbiana; Responsável: Leonardo Guedes de Oliveira;
    • Código Ativ. 20.20.02.005.00.01.008: Manutenção corretiva e evolutiva de softwares componentes da plataforma Alelo para vertente Animal; Responsável: Eduardo de Vaz de Mello Cajueiro.

Ligações externas

1. Portal Alelo Recursos Genéticos
2. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
3. Agriculture Research Service (ARS/EUA)
4. Departamento de Agricultura dos EUA (United States Department of Agriculture – USDA)
5. Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC/Canadá)
6. [www.embrapa.br/arroz-e-feijao Embrapa Arroz e Feijão]
7. Genetic Resource Information Network (GRIN)