Mudanças entre as edições de "Plataforma Alelo Recursos Genéticos"

Edição atual tal como às 14h43min de 4 de janeiro de 2024

Apresentação

A Plataforma Alelo Recursos Genéticos é uma plataforma de serviços de tecnologia da informação (TI), de base Web, dedicada às atividades de conservação e enriquecimento de recursos genéticos (RG) para a alimentação e agricultura desenvolvida pela Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa). A Plataforma Alelo, como é conhecida de forma simplificada, é formada pelo conjunto de infraestrutura de equipamentos de informática (hardware); bases de dados e sistemas de tecnologia da informação (softwares); e pelo conjunto serviços e processos de gestão, treinamento e apoio à documentação de dados e informações das atividades desenvolvidas em núcleos de criação (animal), coleções biológicas (microrganismos), coleções e bancos de germoplasma (vegetal) com foco no tema RG (peopleware) .

Portal da Plataforma Alelo Recursos Genéticos (https://alelo.cenargen.embrapa.br/)

Curadoria de Recursos Genéticos

No âmbito da Embrapa, a Plataforma Alelo Recursos Genéticos atende a três vertentes temáticas relacionadas à conservação de recursos genéticos para o desenvolvimento da pesquisa voltada à segurança alimentar e nutricional, e ao avanço da agricultura. A gestão de atividades desenvolvidas em coleções, bancos ativos de germoplasma e biobancos é feita pela Curadoria de Recursos Genéticos da Embrapa. Para cumprir essa tarefa, cada vertente (animal, microrganismo e vegetal) possui conjunto próprio de recursos de TI, modelados exclusivamente para apoiar as atividades desenvolvidas no âmbito de suas coleções, disponíveis no portal da Plataforma.

Animal

O Sistema de gestão de dados e informações de recursos genéticos da vertente animal foi concebido com a participação de equipes do Brasil, Canadá e Estados Unidos da América (EUA), por meio das respectivas empresas estatais de pesquisa: Brasil: Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa); EUA: Agriculture Research Service (ARS); e Canadá: Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC). Além do sistema de gestão, a vertente animal possui sistema de consulta pública e sítios de apresentação de números gerais da vertente e da Supervisão da Curadoria de RG Animal, com lista de núcleos de criação formalizado, nome e contato dos respectivos curadores/especialistas.

Microrganismos

O sistema AleloMicro é o sistema especializado na gestão de dados de informações de recursos genéticos microbianos. Além do AleloMicro dedicado à gestão, a Vertente Microbiana possui sistemas de busca e consulta pública; sítio de apresentação de números gerais e da Supervisão de Curadoria de Microrganismos da Embrapa, com relação das coleções biológicas e respectivos curadores/especialistas; glossário, manual e tutoriais de apoio aos usuários no espaço AleloWiki.

Vegetal

O sistema AleloVegetal é o sistema especializado na gestão de recursos genéticos vegetais. O sistema possui módulos avançados de documentação e gestão das atividades de conservação desenvolvidas em coleções e bancos de Germoplasma vegetal. O sistema foi denominado inicialmente Acessar, durante o período de migração assistida de dados remanescentes do Sibrargen e de outras bases de dados ainda disponíveis nas atividades de curadorias de recursos genéticos da Embrapa. Atualmente, com apoio do Ministério da Agricultura e Pecuária, o AleloVegetal vem ampliando seu escopo de usuários por meio de parcerias com outras instituições acadêmicas e de pesquisa que atuam no tema RG vegetal. A vertente vegetal possui ainda sistema de busca e consulta pública à base de dados de RG vegetal; sítios de apresentação de números gerais e da Supervisão de Curadoria Vegetal com relação das coleções formalizadas, além de glossário de termos, legislação aplicada, manuais e tutoriais de apoio disponíveis no Espaço AleloWiki.

Breve história da Plataforma

A Embrapa, no cumprimento de sua missão institucional, de fazer pesquisa e levar alimento de qualidade à mesa dos brasileiros, buscou dotar sua equipe de pesquisadores de recursos e ferramentas necessárias ao desenvolvimento da Pesquisa. Desde a década de 80 a empresa se utiliza de ferramentas de informação no manejo de dados de recursos genéticos. A Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, uma de suas unidades descentralizadas (UD), criada em 1974, foi pioneira no Brasil no uso da tecnologia da informação para a gestão de coleções vegetais com o desenvolvimento do Sistema de Informações de Recursos Genéticos (SIRG). No início dos anos 90, o SIRG operou com um conjunto de aplicativos standAlone (sem uso de redes) para microcomputadores. Este foi substituído em 2000 com a adaptação do Genetic Resource Information Network (GRIN), a partir de uma parceria da Embrapa com o Departamento de Agricultura dos EUA (United States Department of Agriculture – USDA). A versão brasileira, denominada Sistema Brasileiro de Informação de Recursos Genéticos (Sibrargen) passou a utilizar o modelo de arquitetura cliente-servidor com base de dados centralizada.

A partir de 2010, a Plataforma Nacional de Recursos Genéticos, concebida para organizar o sistema de curadorias da Embrapa, passou por reformulação e ações estratégicas foram criadas para apoiar as atividades de conservação e gestão de recursos genéticos. O projeto de documentação e informatização de Recursos Genéticos foi aprovado no âmbito do Macroprograma I (Sistema Embrapa de Gestão), permitindo o desenvolvimento do sistema AleloVegetal, em substituição ao Sibrargen, com tecnologia Web e código aberto (open source). O AleloVegetal possui funcionalidades de segurança, gestão e documentação das atividades identificação e registro, avaliação/caracterização e conservação de materiais, desde o cadastro de acessos até a disponibilização das informações para consulta pública, favorecendo o intercâmbio de materiais biológicos e conhecimento entre as coleções de RG. Desde a implantação do AleloVegetal em 2011, os dados e informações das diversas coleções e bancos de germoplasma da Embrapa encontram-se em processo permanente de avaliação, migração e incorporação de informações para a base de dados de Recursos Genéticos da Plataforma Alelo.

Sediada no DataCenter de RG da Embrapa, a Plataforma Alelo Recursos Genéticos veio abrigar o conjunto de sistemas de apoio à gestão das informações produzidas no âmbito dos Recursos Genéticos animal, microrganismo e vegetal, e organizar os demais recursos dedicados ao compartilhamento de documentos, informações sobre legislação, termos de referência, coleções genéticas, área de treinamento, consultas públicas e o Tratado Internacional de Recursos Fitogenéticos para Alimentação e Agricultura (TIRFAA). A Plataforma Alelo foi concebida como um portal de serviços, integrando as diversas UDs da Empresa, por meio da gestão corporativa de dados. O Sistema AleloVegetal, por exemplo, possui função multilínguas e pluri-institucional, com diversos níveis de acesso, garantindo a segurança da informação para diferentes perfis de usuário, desde o curador até o cliente externo. As características e metodologias adotadas no desenvolvimento do AleloVegetal permitem que o sistema seja usado por outras instituições de pesquisa no manejo de dados obtidos nas atividades com recursos genéticos.

O Sistema de gestão de dados de RG Animal, disponível no Plataforma Alelo, foi desenvolvido a partir de parceria entre vários países, por meio de suas empresas estatais de pesquisa: Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa/Brasil), Agriculture Research Service (ARS/EUA), e Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC/Canadá).

A Plataforma Alelo e seu conjunto de sistemas, ferramentas e recursos voltados à gestão de dados e informações de Recursos Genéticos, é fruto do encontro e do empenho de pesquisadores e profissionais de desenvolvimento, e conta com o apoio de parceiros internos e externos, que desde 2010 têm dedicado grande esforço à sua realização. Além da equipe de TI da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, os desafios vencidos até o lançamento da Plataforma Alelo contou com atuação e colaboração da Chefia da Unidade, Macroprograma 1 (Mp1), Departamento de Pesquisa e Desenvolvimento (DPD), Departamento de Tecnologia da Informação (DTI), Secretaria de Relações Internacionais (SRI), Diretoria Executiva (DE), Banco Ativo de Germoplasma (BAG) Arroz e Feijão (CNPAF), Agriculture Research Service (ARS/US), Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC/CA), além de colaboradores externos e profissionais, Curadores e Pesquisadores de diversas unidades descentralizadas da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária – Embrapa.

Informações do projeto Alelo

Equipe Alelo de desenvolvimento

A equipe responsável pelas aplicações e recursos da Plataforma Alelo está lotada no Núcleo de Tecnologia da Informação (NTI) da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, uma das Unidades Descentralizadas da Embrapa:

• Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
• Chefia Adjunta de Pesquisa e Desenvolvimento > E-mail: cenargen.chpd@embrapa.br
• Núcleo de Tecnologia da Informação (NTI) > Sistemas Alelo: E-mail: cenargen.nti@embrapa.br

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• Gilberto de Oliveira Hiragi; Analista, Desenvolvedor, Líder de Projeto
  E-mail: gilberto.hiragi@embrapa.br
• Renato Sales dos Santos; Analista, Desenvolvedor, Líder de atividade
  E-mail: renato.sales@embrapa.br
• Leonardo Guedes de Oliveira; Analista, Desenvolvedor, Líder de atividade
  E-mail: leonardo.oliveira@embrapa.br
• Francisco Régis Ferreira Lopes; Analista, Desenvolvedor, Líder de atividade
  E-mail: francisco.regis@embrapa.br
• Ricardo Berlim; Analista, Desenvolvedor, Líder de atividade
  E-mail: ricardo.berlim@embrapa.br

Identificação do projeto

• Código SEG: 20.20.02.005.00.00 | Início 1/5/2021; Término 31/12/2024;
• Título: REGEN_02_19 Suporte e continuidade de soluções digitais para recursos genéticos na Plataforma Alelo;
• Líder: Gilberto de Oliveira Hiragi | Email gilberto.hiragi@embrapa.br | Cargo Analista;
• Unidade: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecologia;

• Planos de ação (PA)/Solução para Inovação (SI)
• 20.20.02.005.00.01 Gestão do Projeto;
• 20.20.02.005.00.02 Soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos animais na plataforma Alelo;
• 20.20.02.005.00.03 Soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos microbianos na plataforma Alelo;
• 20.20.02.005.00.04 Soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos vegetal na plataforma Alelo.

Gestão de projeto

• Título da Solução para Inovação (SI): Gestão do Projeto
• Plano de ação: 20.20.02.005.00.01 | Início: 01/05/2021; Término: 31/12/2024 | Responsável: Gilberto de Oliveira Hiragi;
• Resultados
• 1) Capacitação de multiplicadores e/ou curadores dos Núcleos de Conservação da Embrapa e Gestores de Recursos Genéticos animais para uso das novas funcionalidades e manutenções evolutivas do AleloAnimal; tipo de Resultado: Capacitação e atualização tecnológica de agentes multiplicadores;
• 2) Capacitação de multiplicadores e/ou curadores de coleções microbianas e Gestores de Recursos Genéticos microbianos para uso das novas funcionalidades e manutenções evolutivas do AleloMicro; tipo de Resultado: Capacitação e atualização tecnológica de agentes multiplicadores;
• 3) Capacitação de multiplicadores e/ou curadores de bancos de germoplasma vegetal e Gestores de Recursos Genéticos vegetais para uso das novas funcionalidades e manutenções evolutivas do AleloVegetal; tipo de Resultado: Capacitação e atualização tecnológica de agentes multiplicadores
• Atividades
• 1. Gerenciamento do projeto, visando a continuidade e desenvolvimento da plataforma digital Alelo para processos e dados de Recursos Genéticos; Código 20.20.02.005.00.01.001; Responsável: Gilberto de Oliveira Hiragi;
• 2. Migração, padronização e atualização de bases de dados de Recursos Genéticos na plataforma Alelo; (Código 20.20.02.005.00.01.002); Responsável: Renato Sales dos Santos;
• 3. Suporte e atendimento aos usuários das soluções de Tecnologia da Informação da plataforma Alelo; Código 20.20.02.005.00.01.003; Responsável: Francisco Régis Ferreira Lopes
• 4. Gestão da infraestrutura de Hardware e Software que hospeda as soluções de Tecnologia da Informação da plataforma Alelo; Código 20.20.02.005.00.01.004; Responsável: Ricardo Berlim Fonseca;
• 5. Proposição, priorização e acompanhamento de demandas para a plataforma Alelo; Código 20.20.02.005.00.01.005; Responsável: Samuel Rezende Paiva;
• 6. Manutenção corretiva e evolutiva de softwares componentes da plataforma Alelo para vertente Vegetal; Código 20.20.02.005.00.01.006; Responsável: Leonardo Guedes de Oliveira;
• 7. Manutenção corretiva e evolutiva de softwares componentes da plataforma Alelo para vertente Microbiana; Código 20.20.02.005.00.01.007; Responsável: Leonardo Guedes de Oliveira;
• 8. Manutenção corretiva e evolutiva de softwares componentes da plataforma Alelo para vertente Animal; Código 20.20.02.005.00.01.008; Responsável: Eduardo de Vaz de Mello Cajueiro.

Recursos Genéticos Animais

• Título da Solução para Inovação (SI): Soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos animais na plataforma Alelo (Solução para Inovação)
• Plano de ação 20.20.02.005.00.02 | Início: 01/05/2021; Término: 31/12/2024 | Responsável: Eduardo de Vaz de Mello Cajueiro;
• Resultados
• 1) Novo Software do Alelo (Portal de Softwares para Gestão de Dados de Recursos Genéticos) para migração de dados com API com desenvolvimento próprio para integração com a plataforma Domestic Animal Diversity Information System (DAD-IS) da FAO; tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala de maturidade: 2021) TRL/MRL 5; 2022) TRL/MRL 7;
• 2) Novo software com tecnologia mobile para celulares componente do Alelo (Portal de Softwares para Gestão de Dados de Recursos Genéticos) para auxiliar os curadores na gestão dos Núcleos de Conservação descentralizados (rebanhos de animais vivos) nas Unidades da Embrapa e os Gestores de Recursos Genéticos; tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala de maturidade: 2022: TRL/MRL 3; 2023: TRL/MRL 5; 2024: TRL/MRL 7;
• 3) Nova Versão do Software de atualização de dados para curadores e responsáveis de Recursos Genéticos Animais contendo melhorias evolutivas com destaque para as novas funções para exibição de mapa de localização de animal (indivíduo) com distribuição geográfica por taxonomia e demonstração de segurança da conservação animal da Embrapa, indicando o percentual do objetivo de coleta que foi atingido para uma raça ou linhagem no AleloAnimal; tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala de maturidade: 2023: TRL/MRL 5; 2024:TRL/MRL 7;
• Atividades
• 1.Desenvolvimento integrado e evoluções incrementais e corretivas de soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos animais no Alelo; Código 20.20.02.005.00.02.001; Responsável: Eduardo de Vaz de Mello Cajueiro;
• 2. Implantação de soluções de Tecnologia da Informação para dados de Recursos Genéticos animais no Alelo; Código 20.20.02.005.00.02.002; Responsável: Renato Sales dos Santos;
• 3. Documentação dos processos de desenvolvimento, teste, homologação e implantação das soluções de Tecnologia da Informação para dados de Recursos Genéticos animais no Alelo; Código 20.20.02.005.00.02.003; Responsável: Francisco Régis Ferreira Lopes;
• 4. Levantamento de requisitos, teste e homologação de soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos animais no Alelo; Código 20.20.02.005.00.02.004; Responsável: Samuel Rezende Paiva;

Recursos Genéticos de Microrganismos

• Título da Solução para Inovação (SI): Soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos microbianos na plataforma Alelo;
• Plano de ação: 20.20.02.005.00.03 | Início: 01/05/2021; Término: 31/12/2024 | Responsável: Renato Sales dos Santos;

• Resultados
• 1) Nova Versão do Software de atualização de dados para curadores e responsáveis de coleções microbianas com novas funcionalidades para caracterização de germoplasma (inclusive caracterização molecular) no AleloMicro. Tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala de maturidade: 2023 TRL/MRL 7;
• 2) Novo software extrator de informações da base de dados microbiana para usuários identificados/validados do Alelo (Portal de Softwares para Gestão de Dados de Recursos Genéticos) com filtros, gráficos, consolidadores e Data Drilling. Tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2021) TRL/MRL 4; 2022) TRL/MRL 7;
• 3) Nova Versão do Software para consultas públicas da base de dados do AleloMicro com novos filtros de dados, novo layout responsivo, possibilidade de extração de dados para CSV/Excel e novos tipos de visualização por gráficos. Tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2021) TRL/MRL 4; 2021) TRL/MRL 7;
• 4) Novo Software para gestão do processo de intercâmbio microbiano integrado a plataforma Alelo, contemplando os novos normativos e a rastreabilidade da movimentação do acervo. Tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2023) TRL/MRL 4; 2024) TRL/MRL 7;
• Atividades
• 1. Desenvolvimento integrado e evoluções incrementais e corretivas de soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos microbiano no Alelo; Código 20.20.02.005.00.03.001; Responsável: Gilberto de Oliveira Hiragi;
• 2. Implantação de soluções de Tecnologia da Informação para dados de Recursos Genéticos microbiano no Alelo; Código 20.20.02.005.00.03.002; Responsável: Renato Sales dos Santos;
• 3. Documentação dos processos de desenvolvimento, teste, homologação e implantação de soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos microbianos no Alelo; Código 20.20.02.005.00.03.003; Responsável: Francisco Régis Ferreira Lopes;
• 4. Levantamento de requisitos, teste e homologação de soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos microbiano no Alelo; Código 20.20.02.005.00.03.004; Responsável: Rogério Biaggione Lopes;
• 5. Proposição, priorização e acompanhamento de demandas para a plataforma Alelo na vertente Microbiana; Código 20.20.02.005.00.03.005; Responsável: Myrian Silvana Tigano;

Recursos Genéticos vegetais

• Título da Solução para Inovação (SI): Soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos vegetal na plataforma Alelo
• Plano de ação: 20.20.02.005.00.04 | Início: 01/05/2021; Término: 31/12/2024 | Responsável: Gilberto de Oliveira Hiragi

• Resultados
• 1) Novo Software para gestão de processos e dados de intercâmbio vegetal do Alelo (Portal de Softwares para Gestão de Dados de Recursos Genéticos) contemplando os normativos vigentes e a rastreabilidade da movimentação do acervo. tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2021) TRL/MRL 7;
• 2) Novo Software para sincronização de dados com gestão por curadores de bancos de germoplasma vegetal de dados do AleloVegetal para o GLIS mantido pela FAO. tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2021) TRL/MRL 7;
• 3) Novo software para gestão de herbários do Alelo (Portal de Softwares para Gestão de Dados de Recursos Genéticos), contemplando processos e dados de coleta e pós-coleta. tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2021) TRL/MRL 5; 2022) TRL/MRL 7;
• 4) Nova Versão do Software de atualização de dados para curadores e responsáveis do AleloVegetal com as novas funcionalidades para dados de caracterização, incluindo gestão de dados de caracterização molecular. tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2022) TRL/MRL 4; 2023) TRL/MRL 7;
• 5) Novo software para dispositivos móveis (aplicativo mobile) para auxílio a gestão de bancos de germoplasma vegetal e consultas a base de dados do AleloVegetal, contemplando alertas, informativos, consultas a dados registrados na base e registro básico de passaporte de materiais coletados. tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2022) TRL/MRL 3; 2023) TRL/MRL 5; 2024) TRL/MRL 7;
• 6) Novo software para gestão de dados de manejo e conservação in situ / sob cultivo (on farm) de recursos genéticos vegetais no AleloVegetal. tipo de Resultado: Software para Clientes Externos; Escala TRL: 2022) TRL/MRL 3; 2023) TRL/MRL 4; 2024) TRL/MRL 7;
• Atividades
• 1. Desenvolvimento integrado e evoluções incrementais e corretivas de soluções de Tecnologia da Informação para processos e dados de Recursos Genéticos Vegetais no Alelo; Código Ativ.: 20.20.02.005.00.04.001; Responsável: Gilberto de Oliveira Hiragi
• 2. Implantação de soluções de Tecnologia da Informação para dados de Recursos Genéticos Vegetais no Alelo; Código Ativ.: 20.20.02.005.00.04.002; Responsável: Renato Sales dos Santos;
• 3. Documentação dos processos de desenvolvimento, teste, homologação e implantação de soluções de Tecnologia da Informação para dados de Recursos Genéticos Vegetais no Alelo; Código Ativ.: 20.20.02.005.00.04.003; Responsável: Francisco Régis Ferreira Lopes;
• 4. Levantamento de requisitos, teste e homologação de soluções de Tecnologia da Informação para dados de Recursos Genéticos Vegetais no Alelo; Código Ativ.: 20.20.02.005.00.04.004; Responsável: Ivo Roberto Sias Costa;
• 5. Proposição, priorização e acompanhamento de demandas para a plataforma Alelo na vertente Vegetal; Código Ativ.: 20.20.02.005.00.04.005; Responsável: Aluna Gonçalves de Abreu;

Ligações externas

1. Portal Alelo Recursos Genéticos
2. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
3. Ministério da Agricultura e Pecuária
4. Agriculture Research Service (ARS/EUA)
5. Departamento de Agricultura dos EUA (United States Department of Agriculture – USDA)
6. Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC/Canadá)
7. Embrapa Arroz e Feijão
8. Genetic Resource Information Network (GRIN)