AleloVegetal: Tutorial como associar taxonomias ao banco ou coleção

AleloVegetal > Tutoriais 1. Introdução ao Sistema AleloVegetal Introdução ao AleloVegetal Introdução ao Módulo Passaporte 2. Criação do banco ou coleção Como cadastrar bancos e coleções Como cadastrar usuários no sistema Como acessar o sistema 3. Documentação de germoplasma Como cadastrar taxonomias do banco Como cadastrar acessos de plantas Como consultar acessos Migração assistida de dados Passaporte estendido: Como inserir dados Como inserir imagens e documentos de acesso 4. consultas, relatórios e mapas Como consultar acessos Como emitir relatórios de Passaporte Como plotar mapas de acesso 5. Gestão de bancos e coleções Como cadastrar bancos e coleções Como cadastrar taxonomias Como atualizar os dados do banco ou coleção Como inserir imagens e documentos do banco ou coleção Como permitir a consulta de dados públicos Como emitir relatórios de Passaporte Como cadastrar usuários e atribuir perfis Como emitir o Certificado AleloVegetal

Introdução

Este tutorial é parte dos materiais de treinamento e apoio aos usuários do Sistema AleloVegetal no uso do Módulo Passaporte. O objetivo deste tutorial é auxiliar o Curador ou responsável por coleção ou banco de germoplasma no AleloVegetal a criar o índice de taxonomias necessário à documentação de seu acervo de recursos genéticos no sistema.

Pré requisitos

1. Como acessar o sistema

Links úteis

1. Sistema AleloVegetal
2. Módulo Passaporte

Sobre o AleloVegetal

O Sistema AleloVegetal está baseado na internet. Para acessá-lo é preciso ter cadastro de usuário em uma das coleções ou banco de germoplasma mantidos no sistema. Recomenda-se acessar o AleloVegetal em computador ou laptop com resolução de tela igual ou superior a 1280px.

Sobre o cadastro de taxonomias no AleloVegetal

O Sistema AleloVegetal possui uma base de dados dedicada exclusivamente ao cadastro de taxonomia de plantas, criada a partir da orientação da equipe de taxonomistas do Herbário da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, unidade de referência da Embrapa. Essa base de dados de taxonomias está em constante desenvolvimento e pode ser revisada e ampliada sempre que necessário. Quando há revisão ou divergência de nomes científicos, por exemplo, são realizadas consultas a diversos herbários no Brasil ou no exterior, conforme a necessidade.

A solicitação de inclusão ou revisão de nome científico na base de dados de taxonomias do AleloVegetal pode ser feita por Curadores ou responsáveis por coleções ou bancos de germoplasma e deve ser encaminhada à equipe de desenvolvimento do AleloVegetal, por meio do endereço eletrônico: cenargen.sistemas@embrapa.br. A revisão ou inclusão de nova taxonomia no AleloVegetal é realizada após consulta e aprovação dos taxonomistas do Herbário da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

Sobre a responsabilidade pelo cadastro de taxonomias

O Curador tem autonomia na definição dos gêneros e nomes científicos de espécies necessários à documentação de seu acervo de recursos genéticos no sistema AleloVegetal. Antes de proceder ao registro dos acessos, o Curador deverá selecionar as taxonomias a serem utilizadas e indexá-las no próprio AleloVegetal, a partir de sua base de dados, para uso corrente de sua coleção ou banco de germoplasma. Na gestão de seu acervo, o Curador pode indexar todo o conjunto de taxonomias de um mesmo gênero de plantas, ou somente o nome científico que atenda a determinada espécie a ser documentada. Ou seja, a indexação de taxonomias é feita por banco ou coleção, e fica sob a responsabilidade do Curador ou responsável pela documentação de sua coleção ou banco de germoplasma.

Procedimentos

Há duas formas de fazer o cadastro de taxonomias da coleção ou do banco de germoplasma no sistema AleloVegetal: a partir do Módulo Passaporte no momento em que o usuário cadastra um acesso, ao perceber que determinada taxonomia não está cadastrada no índice de sua coleção ou banco de germoplasma; ou a partir do Módulo Gestão, em que o usuário tem a oportunidade de organizar todo o índice de taxonomias de seu acervo.

Associar taxonomia a partir do cadastro de acesso

1. Acessar o -Módulo Passaporte; menu -Cadastro; opção -Incluir ou atualizar;
2. Reconhecer na aba -Selecionar acesso os botões principais, localizado abaixo da janela, à esquerda;
3. Clicar no botão + Incluir (Novo);

Ao abrir a janela para incluir novo acesso, o usuário deve consultar o índice de gênero(s) e o nome(s) científico(s) cadastrado(s) para sua coleção ou banco de germoplasma. Esse reconhecimento é importante para manter a gestão das informações de referência do acervo. Para prosseguir ao cadastramento da taxonomia, o usuário deve:

1. Clicar no link -Acrescentar novo nome científico na lista;
2. O usuário deve observar a janela de consulta da base de dados de taxonomias do AleloVegetal;
3. Inserir o nome científico ou parte do nome no campo de texto para consulta;
4. Clicar no botão -Filtrar;

A consulta de nome científico na base de dados de taxonomias do AleloVegetal deve retornar todos os nomes científicos derivados da palavra ou parte da palavra digitada pelo usuário no campo de busca. O usuário deve proceder à seleção do nome científico de seu interesse e observar que poderá selecionar apenas um nome de cada vez. Para prosseguir à indexação do nome científico:

1. Selecione entre os resultados obtidos o nome científico de interesse;
2. Clicar no botão -Escolher;

Ao fazer a seleção do nome científico, a tela retorna para a janela -Cadastrar Novo Acesso, na qual o usuário poderá continuar a fazer o registro do novo acesso. Importante destacar que nesta modalidade de cadastro de taxonomia, apenas aquele nome científico, pertencente pertencente a determinado gênero, é adicionado ao índice de sua coleção ou banco de germoplasma.

Associar taxonomia a partir do Módulo Gestão

A partir do Módulo Gestão é possível ao Curador ou responsável organizar o índice de taxonomia de sua coleção ou banco de germoplasma. Para associar uma nova taxonomia a sua coleção o usuário deve seguir os seguintes passos:

1. Acessar o -Módulo Gestão; Menu -BAG/Coleção; opção -Taxon banco atual;

Figura 1. Tela de acesso à tela de organização do índice de taxonomias do banco atual; 1) opção: Taxon de banco atual.

A tela do usuário permite observar a relação de taxonomias associadas ao acervo (Figura 2). Para continuar, o usuário deve:

1. reconhecer na tela o botão de consulta à lista de valores, -LV;
2. clicar no botão -LV (Figura2, item 1) para consultar a base de dados de taxonomia do AleloVegetal;:

Figura 2. Tela do índice de taxonomias de coleção ou banco de germoplasma; 1) botão de consulta à lista de valores (LV) do banco de dados de taxonomias do AleloVegetal; 2) botão de opção de cadastro, opção para apenas um nome científico ou para todo o conjunto de nomes relacionados ao mesmo gênero; 3) botão -Associar, para fazer a associação do nome escolhido com a coleção ou banco de germoplasma do usuário (Curador ou responsável).

Após clicar no botão -LV, o sistema abre uma janela para consulta à base de dados de taxonomia. O usuário deve:

1. Digitar no campo de busca (figura 4, item 1) o nome científico, ou parte do nome, para consulta à base de dados. Caso o usuário não digite temo para consulta, o sistema retorna como resultado a informação A consulta possui mais de 100 registros. Favor, especificar mais.;
2. Clicar no botão -Filtrar (figura 4, item 2). Observar no resultado da busca os nomes que deseja associar à sua coleção;
3. Fazer avaliação dos nomes que retornaram como resultado da busca e selecionar o nome científico ((figura 4, item 2) que deseja associar à coleção;
4. Clicar no botão -Escolher (figura 4, item 4), para visualizar o nome científico na tela do índice de taxonomia;
5. Selecionar uma das opções de associação: ( ) somente o nome científico selecionado; ou ( ) todos os nomes do gênero;
6. Clicar no botão -Associar para associar o nome(s) científico(s) à sua coleção ou banco de germoplasma.

Figura 4. Tela de consulta e escolha de nome(s) científico(s), para associação ao índice de taxonomias da coleção ou banco de germoplasma; fonte: NTI/Cenargen.;

Mais informações

O AleloWiki é um espaço dedicado ao apoio e compartilhamento de informações sobre os sistemas componentes do Plataforma Alelo Recursos Genéticos. Em caso de dúvidas, críticas, sugestões, pedimos encaminhar mensagem para o endereço eletrônico: cenargen.nti@embrapa.br. Sua contribuição é muito importante. A equipe AleloWiki agradece!