AleloVegetal: Tutorial migração assistida de dados
Migração assistida de dados consiste na atividade realizada pela equipe de documentação da Plataforma Alelo Recursos Genéticos para o reconhecimento, avaliação e importação de planilhas e outros meios de organização de dados e informações de recursos genéticos de modo a formar a base de dados das coleções e bancos de germoplasma componentes da Plataforma Alelo. Uma dos principais objetivos da atividade é evitar duplicatas e inconsistência de dados em sistema. Geralmente as informações em forma de planilha são usadas por pesquisadores e profissionais de coleções e bancos de germoplasma para a gestão de acervo de recursos genéticos.
Índice
Etapas da migração de dados
A atividade da equipe Alelo consiste em receber as informações do Curador ou responsável pelo acervo em seu formato original, conforme sua própria organização, e prepará-la para envio à base de dados do respectivo sistema, conforme a vertente: animal, vegetal ou microrganismo. Algumas etapas são importante até que as informações sejam migradas para a base de dados do Alelo: primeiramente, após o recebimento dos dados, é feita uma primeira avaliação pela equipe de desenvolvimento na qual dúvidas e possíveis inconsistências, como duplicação ou ausências de dados obrigatórios, são verificadas diretamente com o Curador ou responsável. Numa segunda etapa os dados e informações são padronizados e enviados para uma base de dados provisória, para uma nova conferência. Somente após esta última avaliação, os dados são considerados aptos a compor a base de dados do do sistema Alelo, conforme as orientações de restrição definidas pelo Curador, que passa a assumir a gestão das informações.
Importante destacar que para o melhor uso das funcionalidades do Sistema Alelo, a Migração assistida de dados ocorra antes do treinamento dos profissionais no uso da ferramenta, de modo que possam reconhecer suas informações dentro do sistema ao mesmo tempo fazer o uso da funções de gestão disponíveis em seu ambiente. A primeira carga de informações de uma coleção ou banco de germoplasma no Sistema Alelo pode ser feita com os dados básicos que o Curador disponha. É importante porém que estejam em formato digital. Caso ainda não possua os dados digitalizados, recomenda-se que sejam feitos em forma de planilha.
Migração de dados no sistema AleloVegetal
Dados de Passaporte
São considerados dados obrigatórios de Passaporte:
- Código local
- Nome científico
- Data de entrada no BAG/Coleção
- Forma de obtenção
- Código BRA (gerado automaticamente pelo Alelo)
Outros dados importantes
- Status biológico
- Nome comum (*)
- Instituição de procedência
- Local de procedência
- Data de introdução
- Forma de conservação (*)
- Data de obtenção
- Local de obtenção
- Código do coletor
- Latitude
- Longitude
- Altitude
- Observação: para preparo de planilhas, em caso de haver mais de um valor para o mesmo tipo de informação, pode ser inserido uma coluna para cada valor.
O Curador pode informar os dados que tenha disponível, na melhor organização possível. Um acervo mais antigo, por exemplo, pode não possuir dados de georreferenciamento. Nesse casos os dados de município, onde ocorreu a coleta, podem suprir e apoiar futuras consultas. Dados de taxonomia, localidades e instituições, por exemplo, passam por revisão e conferência de informações antes de serem validadas em sistema.
Dados de observação
O Módulo Observação do Sistema Alelo é responsável por armazenar e gerenciar informações das atividades de avaliação e caracterização realizadas nas coleções e bancos de germoplasma do sistema. Para realizar a migração assistida de dados, o Curador deve ter em mãos a definição dos descritores de sua coleção, em arquivo eletrônico. Para dados de ensaio de BAG ou coleção, a equipe Alelo está disponível para apoiar a migração inicial das informações. Uma vez no Alelo, dados e informações passam a ser controlados pelo próprio Curador, no sistema, incluindo as restrições e disponibilidades na web.
Dados de conservação
O Módulo Conservação do sistema AleloVegetal é responsável pelo mapeamento de endereço de localização do acervo de coleção ou BAG. O modelo pode ser usado desde o “endereçamento” florestas, com apoio dos dados de georreferenciamento, como também para localizar o acesso em câmaras frias. por exemplo: Câmara > Corredor > Prateleira > Caixa > Linha > Coluna.
Para simplificar a carga inicial de dados de uma coleção, o Curador deve ter em mãos a definição da estrutura de armazenamento dos acessos organizada por níveis de hierarquia. Além da forma de endereçamento de conservação, indicadores como poder germinativo, umidade, frequência de poda, entre outros, podem ser registrados e controlados pelo próprio Curador no sistema Alelo.
Envio de informações
O envio de planilhas e documentos pode ser feito por meio dos e-mails: cenargen.nti@embrapa.br; gilberto.hiragi@embrapa.br (Supervisor do NTI); renato.sales@embrapa.br (Desenvolvedor)
O Curador deve informar no e-mail:
- nome do BAG/Coleção;
- breve descritivo do conteúdo enviado;
- nome do Curador; e
- nome dos Empregados para gestão dos dados no Alelo.
Prazo de migração de dados
O tempo necessário à migração de dados para o sistema Alelo depende da qualidade e quantidade de dados enviado pelo Curador. O prazo médio é de 15 dias e depende da demanda existente à época do envio da planilha e da qualidade dos dados constantes no arquivo enviado. No final do ano por exemplo, quando se faz importante para Curadores a produção de relatórios de desempenho, é comum haver uma grande quantidade de demandas para o setor.
