Mudanças entre as edições de "Sistema AleloMicro"

Edição atual tal como às 16h40min de 31 de outubro de 2022

O Sistema AleloMicro é um dos sistemas componentes do Plataforma Alelo Recursos Genéticos, plataforma web de recursos e ferramentas de gestão de dados e informações de pesquisa e desenvolvimento da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa). O objetivo do Sistema AleloMicro é fazer a gestão de dados e informações de microrganismos das coleções de referência e de trabalho da Embrapa e instituições parceiras, usuárias do Sistema.

O Sistema AleloMicro foi concebido por equipe multidisciplinar da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, Unidade Descentralizada da Embrapa, com projetos de pesquisa e desenvolvimento voltados à gestão de coleções de microrganismos das mais diversas áreas de interesse: processos produtivos da área agrícola e industrial, produção de energia, meio ambiente, medicina e saúde, entre outros.

Breve histórico

A história das coleções de microrganismos da Embrapa vem sendo construída desde o início da criação da empresa no ano de 1973. A Coleção de Microrganismos de Interesse para a Suinocultura e Avicultura, por exemplo, teve seu primeiro registro oficial, em livro ata de 1977, que à época denominou como “Bacterioteca CNPSu – Embrapa”, cuja finalidade era armazenar amostras de bactérias patogênicas isoladas de amostras clínicas de suínos ^[1]. Esforços no sentido de organizar essas coleções de microrganismos de forma conjunta vêm sendo conduzidas pela empresa desde 2002, por meio da criação de projetos em rede.

No ano de 2008, a Embrapa constituiu novo projeto de organização com o objetivo de desenvolver uma “plataforma de recursos genéticos” em forma de rede, subdividida em vertentes temáticas da área animal, vegetal e microbiana. No âmbito das coleções microbianas, havia à época aproximadamente 28.000 isolados armazenados na Embrapa, em 20 coleções (incluindo bactérias, fungos, leveduras e vírus) de interesse da pesquisa agropecuária. Neste mesmo ano teve início a criação e desenvolvimento do sistema Infomicro, dedicado à organização e controle das coleções microbianas da Embrapa ^[2].

A Embrapa tem dedicado esforço na valorização dos ativos conservados na forma de coleção, vem atuando para a organização dessas coleções em projetos de rede com objetivo de sistematizar atividades e processos comuns ao tema. Nesse sentido, a criação do Sistema AleloMicro, em 2011, de maior alcance e capacidade de gestão desse importante ativo de pesquisa, vem ao encontro dessa necessidade de organização dos dados e informações gerados a partir das atividades de conservação, manejo e enriquecimento desenvolvidas no escopo de atuação dessas coleções de microrganismos.

Modelo conceitual

Inicialmente, o AleloMicro adotou conceitos e modelos de representação que expressavam a organização das coleções de microrganismo da Embrapa, mas ao longo de seu desenvolvimento, e diante do avanço dos modelos de desenvolvimento dos sistemas em outras vertentes de gestão de recursos genéticos (animal e vegetal) novos modelos foram incorporados ao seu escopo de desenvolvimento. O esquema a seguir ilustra de modo simplificado a estrutura e os conceitos de Linhagem (microrganismo), de Subcoleção, de acesso ou item de subcoleção (linhagem específica dentro de determinada Subcoleção) e amostra do acesso ou item de subcoleção (componente físico na coleção = criotubo, ampola, etc):

Modelo conceitual de apresentação de coleção, item de coleção, amostra de item de coleção e linhagem^[3];

Conceitos de organização e representação do Sistema AleloMicro

• Escopo – define ente genérico padrão para organização de um conjunto de coleções registrado no Sistema AleloMicro. Uma vez definido um escopo, é possível vincular um conjunto de regras para o elenco de coleções a ele vinculado, com perfi de acesso diferenciado para cada coleção componente, gestão de registros em base de dados e níveis de responsabilidade de usuário, conforme a coleção em que esteja cadastrado. Na base de dados do Sistema AleloMicro destaca-se como exemplo de escopo as Coleções Microbianas da Embrapa, com mais de treze coleções componentes (2018).
• Coleção – organização formal de acervo de germoplasma microbiano, temático, institucional, para a realização de atividades de depósito, conservação, identificação, caracterização e intercâmbio de germoplasma; atua de acordo com protocolos de pesquisa e requisitos de Qualidade. Como exemplo de coleção, apresenta-se a Coleção de Recurso Biológico (CRB) de Microrganismos Multifuncionais: Bactérias Diazotróficas e Promotoras de Crescimento Vegetal, componente do escopo Coleções Microbianas da Embrapa;
• Subcoleção – é uma conjunto organizado e formal componente de determinada coleção temática ou institucional, cujo objetivo é organizar acervo de microrganismo com tipo e finalidade específicos para realização de atividades de pesquisa. A Coleção de Invertebrados da Embrapa, por exemplo, apresenta duas subcoleções: a Coleção de Nematóides de Importância Agrícola da Embrapa Clima Temperado, localizada na unidade da Embrapa, em Pelotas-RS, e a Coleção de Nematóides do Gênero Meloidogyne, em Brasília (DF), na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia;
• Item de coleção (ou acesso) – linhagem específica componente de determinada coleção;
• Linhagem – microrganismo em cepa ou isolado disponível em forma de acesso em uma ou mais coleções;
• Amostra de acesso ou item de subcoleção – componente físico de germoplasma armazenado em acervo de coleção = criotubo, ampola, etc;

Glossário de termos do Sistema AleloMicro | Glossário de términos del Sistema AleloMicro

1. Glossário | Glosario

Acessar o sistema

O sistema AleloMicro está baseado na Web, no endereço: https://am.cenargen.embrapa.br/amsistema, e somente pessoas cadastradas podem acessá-lo. As chaves de acesso (login e senha) são elaboradas a partir do Código de Pessoa Física (CPF) do usuário, utilizado como login, e senha inicial fornecida pelo administrador do Sistema, encaminhada para o e-mail do usuário.

Alterar senha

1. Após entrar no sistema, acessar a aba “Minha Conta”;
2. selecionar a opção “Minha Conta” e entrar na opção “Alterar Senha”.
3. Preencher o quadro com a senha enviada pelo administrador;
4. colocar a nova senha no campo indicado e no campo confirmação;
5. Clicar no botão “alterar”.

A alteração da senha é importante para segurança dos dados no sistema.

Referências e links externos

1. ↑ Projeto REGEN_06_19_ Conservação de Coleções de Microrganismos da Embrapa; No. 10.20.02.009.00.00; Sistema Quaesta: Projeto Tipo I (Pesquisa e Desenvolvimento); Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária; Brasília-DF, 1/5/2021;
2. ↑ INFOMICRO: Sistema de informações de coleções de microrganismos da Embrapa; MELO L. A. M. P., LOPES, R. B.; TIGANO, M S.; HIRAGI, G. O.; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Brasília-DF, 1/5/2011.
3. ↑ Manual de gestão da coleção de bactérias de invertebrados: Instrução Técnica de Uso de Sistema AleloMicro para Coleções Microbianas. Núcleo de Gestão da Qualidade (NGQ), Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Brasília-DF; 2015.