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O Sistema AleloVegetal é um sistema desenvolvido pela Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia cujo objetivo é fazer a gestão dos recursos genéticos vegetais dos [[Banco Ativo de Germoplasma | Bancos de Germoplasma]] e coleções de base da Embrapa. O sistema é parte integrante do [http://alelo.cenargen.embrapa.br/ Portal Alelo Recursos Genéticos] que abriga o conjunto de sistemas e ferramentas de apoio às atividades de gestão de dados e informações de pesquisa e desenvolvimento com recursos genéticos em suas diversas vertentes: animal, microrganismos e vegetal.O [[Sistema AleloVegetal]] recebeu inicialmente a denominação de Sistema Acessar e, atualmente, além das informações alimentadas pelos [[Banco Ativo de Germoplasma | Bancos Ativos de Germoplasma]] (BAGs) da Embrapa, abriga os dados remanescentes do [[Sibrargen]] (Sistema Brasileiro de Informações de Recursos Genéticos) pioneiro sistema aplicativo da Embrapa na área.
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O [[AleloVegetal: Sistema AleloVegetal | Sistema AleloVegetal]] é o ''software'' da [[Plataforma Alelo Recursos Genéticos]] desenvolvido para o gerenciamento de dados e informações de atividades de conservação e manejo de coleções de recursos genéticos de plantas. O sistema foi desenvolvido pela Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, uma das unidades de referência da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária ([[Embrapa]]), e nasceu com o objetivo de fazer a gestão das informações de recursos genéticos vegetais de [[Banco Ativo de Germoplasma | bancos de germoplasma]] e coleções mantidas pela ([[Embrapa]]). O sistema é parte integrante do [http://alelo.cenargen.embrapa.br/ Portal Alelo Recursos Genéticos] que abriga um conjunto de sistemas e ferramentas de apoio às atividades de pesquisa e desenvolvimento com recursos genéticos, em suas diversas vertentes: animal, microrganismos e vegetal. O [[Sistema AleloVegetal| AleloVegetal]] recebeu inicialmente a denominação de Sistema Acessar e, atualmente, além das informações remanescentes do [[Sibrargen]] (Sistema Brasileiro de Informações de Recursos Genéticos), faz a gestão de dados e informações produzidas pelos [[Banco Ativo de Germoplasma | Bancos Ativos de Germoplasma]] (BAGs) da Embrapa e de outras instituições que atuam no tema recursos genéticos no Brasil.
  
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O [[Sistema AleloVegetal]] possui seis módulos de gerenciamento de dados e informações, quatro módulos de manejo de dados e informações e dois de gestão de bancos e coleções de germoplasma:
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==Módulos do AleloVegetal==
  
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===Módulos de manejo de dados e informações===
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O sistema AleloVegetal é formado por subsistemas, denominados “módulos”, com funções específicas: de identificação e catalogação das coleções; registro de atividades de avaliação e caracterização de espécies conservadas; organização do acervo em suas rotinas de armazenamento de amostras; e outras atividades comuns ao dia a dia de coleções e bancos de germoplasma. Os módulos do AleloVegetal são subsistemas interdependentes, quatro de manejo de dados e informações de acervo de plantas e dois de gestão de bancos e coleções de germoplasma:
  
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#[[Módulo Passaporte]]
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===Módulos de administração do banco ou coleção de germoplasma===
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===Modelo de desenvolvimento baseado em metadados===
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==Módulo Passaporte==
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Apesar de o [[Sistema AleloVegetal]] tratar da área específica de conservação e manejo de recursos genéticos vegetal em suas diversas modalidades, dificilmente haveria um sistema capaz de documentar com precisão as várias formas de representação dessas atividades e de objetos tão diferenciados como palmeiras, gramíneas, hortaliças, fruteiras, tubérculos, etc, ou seja, capaz de documentar a própria natureza em toda a sua diversidade. Cada planta e sua forma de conservação e estudo possui especificidades próprias. Por mais que houvesse equipes de tecnologia da informação dispostas a compreender o tema e definir requisitos e estruturas de documentação, a cada novo tipo de produto haveria a necessidade de manutenção e até mesmo redesenho do sistema para atender às novas características a ser documentadas. A partir da observação dessas necessidades, o Sistema AleloVegetal foi concebido em modelo diferenciado de desenvolvimento, com base no conceito de metadados, no qual a informação é construída a partir dos próprios dados e informações que definem o objeto de representação no sistema, neste caso, a partir dos termos descritivos do tema recursos genéticos. A literatura da área costuma classificar metadados em cinco tipos básicos: administrativos, descritivos, de preservação, técnicos e de uso, os quais são utilizados para a descrição de recursos informacionais em geral <ref>Brandt, M. B.; Vidotti, S. A. B; Metadados de negócio: representação da informação dos processos de trabalho; Revista Transinformação; Transinformação vol.31  Campinas  2019  Epub Feb 07, 2019 (https://doi.org/10.1590/2318-0889201931e180006 );</ref>.
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No sistema AleloVegetal as principais estruturas de informação foram organizadas em tabelas de referência, de modo a permitir estruturar e atualizar a informação com mais flexibilidade e atender a cada novo tipo de informação a ser documentado no sistema. São exemplos de tabelas de referência:
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Tanto a sua aplicação como sua base de dados são aprimorados ao longo do tempo, durante o processo de importação assistida de dados e informações de registros de bancos e coleções de germoplasma para o sistema. Após o reconhecimento das informações do acervo, curadores e gestores de coleções e bancos de germoplasma, com a colaboração da equipe de desenvolvimento do sistema, têm a permissão para definir os tipos de dados que melhor atendam às especificidades de identificação do acesso. Os tipos de dados são definidos nas tabelas de referência, modelo genérico de desenvolvimento que permite maior versatilidade na atividade de manutenção do sistema, ao mesmo tempo aproxima desenvolvedores, curadores e equipes de apoio na gestão do conhecimento voltado às atividades de bancos e coleções de germoplasma.
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===Plataforma Web===
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O sistema AleloVegetal pode ser acessado a qualquer tempo e lugar, de qualquer parte do mundo, a partir de dispositivos com acesso à internet como computadores ''desktop'', ''tablets'' ou mesmo telefone celular. Sua base de infraestrutura, atualmente, está sediada na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, com servidor dedicado à aplicação do sistema e à base de dados de recursos genéticos vegetal, com protocolos de acesso e segurança, cópias backups com proteção, manutenção permanente de estabilidade e disponibilidade de serviços web.
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===Identificador único===
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O conceito de identificador único é característica importante no modelo de desenvolvimento do Sistema AleloVegetal. Cada acesso de planta registrado no sistema recebe um número identificador que o distingue como indivíduo único no sistema, garantindo o registro e a rastreabilidade de todas as operações a ele relacionadas no âmbito do sistema. A partir da Embrapa, no tema recursos genéticos, este identificador único foi denominado [[BRA | Código BRA]], em referência ao código do Brasil (BRA) do padrão ISO de identificação internacional de países.
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===Lista de valores (LV) compartilhados===
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Além da base de dados de recursos genéticos de plantas, composta pelos registros de acessos das inúmeras coleções e bancos de germoplasma cadastrados no AleloVegetal, o sistema apresenta em seu banco de dados, tabelas de referência com listas de valores (LV) de informação especializadas, em apoio à gestão e estabilidade da base de dados do sistema. Cada uma dessas listas de valores possui função específica no sistema de modo a assegurar a unicidade dos dados e informações a todas as coleções e bancos de germoplasma. O principal objetivo das listas de valores (LV) é evitar erros de transcrição, duplicidades, e a consequente inconsistência da base de dados, uma vez possuir fontes diversas de alimentação. Cada tabela de referência e sua respectiva lista de valores recebem tratamento específico e a curadoria de especialistas e técnicos de sistema. A lista de valores (LV) de taxonomias, por exemplo, recebe continuamente a avaliação e curadoria de dados da Equipe de Taxonomistas do Herbário da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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|Equipe de taxonomistas do Herbário da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
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|Assegurar o devido registro de localização geográfica nos diversos campos de identificação de informações de instituições, local de obtenção de acessos, local de coleções e bancos de germoplasma, localização de ensaios, locais de conservação, outros.
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|ISO 3166; [https://cidades.ibge.gov.br/ IBGE];
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|Assegurar registro único de pessoas nos diversos campos de identificação de equipes, coletores, responsáveis, autores, etc.
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|Curadores e responsáveis por registro de informações no sistema
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===Multilínguas===
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O Sistema AleloVegetal foi concebido em camadas de informação que permite, entre outras funções, construir versões de informação em idiomas diversos. Atualmente o sistema possui as versões em Português e Inglês, que atende a várias demandas de informação das coleções e bancos de germoplasma, e vem avançando nas traduções para o Espanhol e o Francês. Destaca se no modelo de tradução do sistema AleloVegetal que há uma camada de informação que representa a interface do sistema, na apresentação de botões, menus, índice de tabelas, e informações adicionais das telas do usuário. Além dessa interface, há outra camada que traduz a informação das coleções e bancos de germoplasma, sob a responsabilidade do Curador, na qual são traduzidos os dados e informações alimentados pela documentação do acervo. O modelo de desenvolvimento do Sistema AleloVegetal, baseado em metadados, permite a inclusão de outros idiomas, a qualquer momento, porém exige um plano de versionamento que faça a previsão da tradução das diversas camadas de informação da interface do sistema, bem como a necessidade de alimentação da respectiva versão na camada de documentação da coleção por parte do curador responsável.
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===Multi-institucional===
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O sistema AleloVegetal possui desenho de base de dados com modelo relacional e desenho genérico de representação de dados baseado em metadados, o que permite a portabilidade de dados o compartilhamento de informações com outros sistemas e plataformas informatizadas.
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#Genesys-pgr
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===Certificado AleloVegetal===
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===Camada restrita e camada pública de dados===
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==Padrões de arquitetura==
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O conjunto de recursos de tecnologia da informação dedicados ao ''software'' AleloVegetal, componente da Plataforma Alelo, tem por objetivo principal garantir os princípios de integridade, confidencialidade, rastreabilidade e a devida recuperação de dados e informações, em caso de incidentes operacionais. Para mais informações consultar a página [[Plataforma Alelo: arquitetura | Padrões de arquitetura da Plataforma Alelo]].
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==Referências==
  
 
[[Categoria:Sistema AleloVegetal]]
 
[[Categoria:Sistema AleloVegetal]]

Edição atual tal como às 09h32min de 19 de junho de 2023

O Sistema AleloVegetal é o software da Plataforma Alelo Recursos Genéticos desenvolvido para o gerenciamento de dados e informações de atividades de conservação e manejo de coleções de recursos genéticos de plantas. O sistema foi desenvolvido pela Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, uma das unidades de referência da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), e nasceu com o objetivo de fazer a gestão das informações de recursos genéticos vegetais de bancos de germoplasma e coleções mantidas pela (Embrapa). O sistema é parte integrante do Portal Alelo Recursos Genéticos que abriga um conjunto de sistemas e ferramentas de apoio às atividades de pesquisa e desenvolvimento com recursos genéticos, em suas diversas vertentes: animal, microrganismos e vegetal. O AleloVegetal recebeu inicialmente a denominação de Sistema Acessar e, atualmente, além das informações remanescentes do Sibrargen (Sistema Brasileiro de Informações de Recursos Genéticos), faz a gestão de dados e informações produzidas pelos Bancos Ativos de Germoplasma (BAGs) da Embrapa e de outras instituições que atuam no tema recursos genéticos no Brasil.

Módulos do AleloVegetal

O sistema AleloVegetal é formado por subsistemas, denominados “módulos”, com funções específicas: de identificação e catalogação das coleções; registro de atividades de avaliação e caracterização de espécies conservadas; organização do acervo em suas rotinas de armazenamento de amostras; e outras atividades comuns ao dia a dia de coleções e bancos de germoplasma. Os módulos do AleloVegetal são subsistemas interdependentes, quatro de manejo de dados e informações de acervo de plantas e dois de gestão de bancos e coleções de germoplasma:

AleloVegetal >
Sistema AleloVegetal
  1. Módulo Passaporte | Módulo pasaporte
  2. Módulo Observação | Módulo Observación
  3. Módulo Conservação | Módulo Conservación
  4. Módulo Movimentação | Módulo Movimientación
  5. Módulo Gestão | Módulo Gestión
  6. Módulo Configurações | Módulo Configuraciones

Premissas de desenvolvimento

Modelo de desenvolvimento baseado em metadados

Apesar de o Sistema AleloVegetal tratar da área específica de conservação e manejo de recursos genéticos vegetal em suas diversas modalidades, dificilmente haveria um sistema capaz de documentar com precisão as várias formas de representação dessas atividades e de objetos tão diferenciados como palmeiras, gramíneas, hortaliças, fruteiras, tubérculos, etc, ou seja, capaz de documentar a própria natureza em toda a sua diversidade. Cada planta e sua forma de conservação e estudo possui especificidades próprias. Por mais que houvesse equipes de tecnologia da informação dispostas a compreender o tema e definir requisitos e estruturas de documentação, a cada novo tipo de produto haveria a necessidade de manutenção e até mesmo redesenho do sistema para atender às novas características a ser documentadas. A partir da observação dessas necessidades, o Sistema AleloVegetal foi concebido em modelo diferenciado de desenvolvimento, com base no conceito de metadados, no qual a informação é construída a partir dos próprios dados e informações que definem o objeto de representação no sistema, neste caso, a partir dos termos descritivos do tema recursos genéticos. A literatura da área costuma classificar metadados em cinco tipos básicos: administrativos, descritivos, de preservação, técnicos e de uso, os quais são utilizados para a descrição de recursos informacionais em geral [1].

No sistema AleloVegetal as principais estruturas de informação foram organizadas em tabelas de referência, de modo a permitir estruturar e atualizar a informação com mais flexibilidade e atender a cada novo tipo de informação a ser documentado no sistema. São exemplos de tabelas de referência:

  • Tabela formas de obtenção;
  • Tabela formas de conservação;
  • Tabela tipos de uso;

Tanto a sua aplicação como sua base de dados são aprimorados ao longo do tempo, durante o processo de importação assistida de dados e informações de registros de bancos e coleções de germoplasma para o sistema. Após o reconhecimento das informações do acervo, curadores e gestores de coleções e bancos de germoplasma, com a colaboração da equipe de desenvolvimento do sistema, têm a permissão para definir os tipos de dados que melhor atendam às especificidades de identificação do acesso. Os tipos de dados são definidos nas tabelas de referência, modelo genérico de desenvolvimento que permite maior versatilidade na atividade de manutenção do sistema, ao mesmo tempo aproxima desenvolvedores, curadores e equipes de apoio na gestão do conhecimento voltado às atividades de bancos e coleções de germoplasma.

Plataforma Web

O sistema AleloVegetal pode ser acessado a qualquer tempo e lugar, de qualquer parte do mundo, a partir de dispositivos com acesso à internet como computadores desktop, tablets ou mesmo telefone celular. Sua base de infraestrutura, atualmente, está sediada na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, com servidor dedicado à aplicação do sistema e à base de dados de recursos genéticos vegetal, com protocolos de acesso e segurança, cópias backups com proteção, manutenção permanente de estabilidade e disponibilidade de serviços web.

Identificador único

O conceito de identificador único é característica importante no modelo de desenvolvimento do Sistema AleloVegetal. Cada acesso de planta registrado no sistema recebe um número identificador que o distingue como indivíduo único no sistema, garantindo o registro e a rastreabilidade de todas as operações a ele relacionadas no âmbito do sistema. A partir da Embrapa, no tema recursos genéticos, este identificador único foi denominado Código BRA, em referência ao código do Brasil (BRA) do padrão ISO de identificação internacional de países.

Lista de valores (LV) compartilhados

Além da base de dados de recursos genéticos de plantas, composta pelos registros de acessos das inúmeras coleções e bancos de germoplasma cadastrados no AleloVegetal, o sistema apresenta em seu banco de dados, tabelas de referência com listas de valores (LV) de informação especializadas, em apoio à gestão e estabilidade da base de dados do sistema. Cada uma dessas listas de valores possui função específica no sistema de modo a assegurar a unicidade dos dados e informações a todas as coleções e bancos de germoplasma. O principal objetivo das listas de valores (LV) é evitar erros de transcrição, duplicidades, e a consequente inconsistência da base de dados, uma vez possuir fontes diversas de alimentação. Cada tabela de referência e sua respectiva lista de valores recebem tratamento específico e a curadoria de especialistas e técnicos de sistema. A lista de valores (LV) de taxonomias, por exemplo, recebe continuamente a avaliação e curadoria de dados da Equipe de Taxonomistas do Herbário da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

Listas de Valores (LV) objetivo referências
Taxonomias Indexar a lista de nomes científicos de espécies de plantas para registro de passaporte de acessos Equipe de taxonomistas do Herbário da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia
Instituições Identificar instituições e hierarquia de relacionamento de coleções e bancos de germoplasma Curadores e responsáveis por registro de informações no sistema
Localidades Assegurar o devido registro de localização geográfica nos diversos campos de identificação de informações de instituições, local de obtenção de acessos, local de coleções e bancos de germoplasma, localização de ensaios, locais de conservação, outros. ISO 3166; IBGE;
Pessoas Assegurar registro único de pessoas nos diversos campos de identificação de equipes, coletores, responsáveis, autores, etc. Curadores e responsáveis por registro de informações no sistema

Multilínguas

O Sistema AleloVegetal foi concebido em camadas de informação que permite, entre outras funções, construir versões de informação em idiomas diversos. Atualmente o sistema possui as versões em Português e Inglês, que atende a várias demandas de informação das coleções e bancos de germoplasma, e vem avançando nas traduções para o Espanhol e o Francês. Destaca se no modelo de tradução do sistema AleloVegetal que há uma camada de informação que representa a interface do sistema, na apresentação de botões, menus, índice de tabelas, e informações adicionais das telas do usuário. Além dessa interface, há outra camada que traduz a informação das coleções e bancos de germoplasma, sob a responsabilidade do Curador, na qual são traduzidos os dados e informações alimentados pela documentação do acervo. O modelo de desenvolvimento do Sistema AleloVegetal, baseado em metadados, permite a inclusão de outros idiomas, a qualquer momento, porém exige um plano de versionamento que faça a previsão da tradução das diversas camadas de informação da interface do sistema, bem como a necessidade de alimentação da respectiva versão na camada de documentação da coleção por parte do curador responsável.

Multi-institucional

Maturidade de desenvolvimento

Portabilidade de dados e compartilhamento

O sistema AleloVegetal possui desenho de base de dados com modelo relacional e desenho genérico de representação de dados baseado em metadados, o que permite a portabilidade de dados o compartilhamento de informações com outros sistemas e plataformas informatizadas.

  1. Genesys-pgr
  2. GLIS

Certificado AleloVegetal

Camada restrita e camada pública de dados

Padrões de arquitetura

O conjunto de recursos de tecnologia da informação dedicados ao software AleloVegetal, componente da Plataforma Alelo, tem por objetivo principal garantir os princípios de integridade, confidencialidade, rastreabilidade e a devida recuperação de dados e informações, em caso de incidentes operacionais. Para mais informações consultar a página Padrões de arquitetura da Plataforma Alelo.

Referências

  1. ↑ Brandt, M. B.; Vidotti, S. A. B; Metadados de negócio: representação da informação dos processos de trabalho; Revista Transinformação; Transinformação vol.31 Campinas 2019 Epub Feb 07, 2019 (https://doi.org/10.1590/2318-0889201931e180006 );
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