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O Sistema AleloMicro é um dos sistemas componentes do [http://alelo.cenargen.embrapa.br/ Portal Alelo Recursos Genéticos], plataforma web de recursos e ferramentas de gestão de dados e informações de pesquisa e desenvolvimento da [[Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária]] (Embrapa). O objetivo do Sistema AleloMicro é fazer a gestão de dados de microrganismos das [[Coleção|coleções de referência]] e de trabalho da Embrapa.  
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O Sistema AleloMicro é um dos sistemas componentes do [https://alelo.cenargen.embrapa.br/ Plataforma Alelo Recursos Genéticos], plataforma web de recursos e ferramentas de gestão de dados e informações de pesquisa e desenvolvimento da [[Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária]] (Embrapa). O objetivo do Sistema AleloMicro é fazer a gestão de dados e informações de microrganismos das [[Coleção|coleções de referência]] e de trabalho da Embrapa e instituições parceiras, usuárias do Sistema.  
  
O Sistema AleloMicro foi concebido por equipe multidisciplinar liderada por Pesquisadores da [[Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia]], Unidade Descentralizada da [[Embrapa]], com projetos de pesquisa e desenvolvimento voltados à gestão de coleções de microrganismo.
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O Sistema AleloMicro foi concebido por equipe multidisciplinar da [[Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia]], Unidade Descentralizada da [[Embrapa]], com projetos de pesquisa e desenvolvimento voltados à gestão de coleções de microrganismos das mais diversas áreas de interesse: processos produtivos da área agrícola e industrial, produção de energia, meio ambiente, medicina e saúde, entre outros.
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==Breve histórico==
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A história das coleções de microrganismos da Embrapa vem sendo construída desde o início da criação da empresa no ano de 1973. A Coleção de Microrganismos de Interesse para a Suinocultura e Avicultura, por exemplo, teve seu primeiro registro oficial, em livro ata de 1977, que à época denominou como “Bacterioteca CNPSu – Embrapa”, cuja finalidade era armazenar amostras de bactérias patogênicas isoladas de amostras clínicas de suínos <ref>Projeto REGEN_06_19_ Conservação de Coleções de Microrganismos da
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Embrapa; No. 10.20.02.009.00.00; Sistema Quaesta: Projeto Tipo I (Pesquisa e Desenvolvimento); Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária; Brasília-DF, 1/5/2021;</ref>. Esforços no sentido de organizar essas coleções de microrganismos de forma conjunta vêm sendo conduzidas pela empresa desde 2002, por meio da criação de projetos em rede.
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No ano de 2008, a Embrapa constituiu novo projeto de organização com o objetivo de desenvolver uma “plataforma de recursos genéticos” em forma de rede, subdividida em vertentes temáticas da área animal, vegetal e microbiana. No âmbito das coleções microbianas, havia à época aproximadamente 28.000 isolados armazenados na Embrapa, em 20 coleções (incluindo bactérias, fungos, leveduras e vírus) de interesse da pesquisa agropecuária. Neste mesmo ano teve início a criação e desenvolvimento do sistema ''Infomicro'', dedicado à organização e controle das coleções microbianas da Embrapa <ref>INFOMICRO: Sistema de informações de coleções de microrganismos da Embrapa; MELO L. A. M. P., LOPES, R. B.; TIGANO, M S.; HIRAGI, G. O.; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Brasília-DF, 1/5/2011.</ref>.
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A Embrapa tem dedicado esforço na valorização dos ativos conservados na forma de coleção, vem atuando para a organização dessas coleções em projetos de rede com objetivo de sistematizar atividades e processos comuns ao tema. Nesse sentido, a criação do [[Sistema AleloMicro]], em 2011, de maior alcance e capacidade de gestão desse importante ativo de pesquisa, vem ao encontro dessa necessidade de organização dos dados e informações gerados a partir das atividades de conservação, manejo e enriquecimento desenvolvidas no escopo de atuação dessas coleções de microrganismos.
  
 
==Modelo conceitual==
 
==Modelo conceitual==
  
O AleloMicro adota conceitos e modelos de representação que expressam a organização das coleções de microrganismo da Embrapa. O esquema a seguir ilustra de modo simplificado a estrutura e os conceitos de Linhagem (microrganismo), de Subcoleção, de acesso ou item de subcoleção (linhagem específica dentro de determinada Subcoleção) e amostra do acesso ou item de subcoleção (componente físico na coleção = criotubo, ampola, etc):
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Inicialmente, o AleloMicro adotou conceitos e modelos de representação que expressavam a organização das coleções de microrganismo da Embrapa, mas ao longo de seu desenvolvimento, e diante do avanço dos modelos de desenvolvimento dos sistemas em outras vertentes de gestão de recursos genéticos (animal e vegetal) novos modelos foram incorporados ao seu escopo de desenvolvimento. O esquema a seguir ilustra de modo simplificado a estrutura e os conceitos de Linhagem (microrganismo), de Subcoleção, de acesso ou item de subcoleção (linhagem específica dentro de determinada Subcoleção) e amostra do acesso ou item de subcoleção (componente físico na coleção = criotubo, ampola, etc):
  
[[Arquivo:SistemaAleloMicro_esquemaConceitual_colecao_.png|800px|thumb|none|Modelo conceitual de apresentação de coleção, item de coleção, amostra de item de coleção e linhagem;]]<ref>Manual de gestão da coleção de bactérias de invertebrados: Instrução Técnica de Uso de Sistema AleloMicro para Coleções Microbianas. Núcleo de Gestão da Qualidade (NGQ), Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Brasília-DF; 2015.</ref>
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[[Arquivo:SistemaAleloMicro_esquemaConceitual_colecao_.png|800px|thumb|none|Modelo conceitual de apresentação de coleção, item de coleção, amostra de item de coleção e linhagem<ref>Manual de gestão da coleção de bactérias de invertebrados: Instrução Técnica de Uso de Sistema AleloMicro para Coleções Microbianas. Núcleo de Gestão da Qualidade (NGQ), Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Brasília-DF; 2015.</ref>;]]
  
*'''Coleções''' – organização formal de acervo de germoplasma microbiano para a realização de atividades de depósito, identificação e fornecimento de germoplasma, de acordo com requisitos de qualidade; internacionais
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===Conceitos de organização e representação do Sistema AleloMicro===
*'''item de coleção''' (ou acesso)  – linhagem específica dentro de determinada coleção;
 
*'''Linhagem'''  – microrganismo em cepa ou isolado disponível em forma de acesso em uma ou mais coleções;
 
  
A linhagem possui, no sistema, uma tela para cadastramento de seus detalhes (“certidão de nascimento”) referentes ao local de sua coleta, pessoal envolvido em sua coleta e sua identificação taxonômica e características gerais. A linhagem tem como identificador principal um número inteiro (código) que segue o prefixo “BRM’. Assim, existirá um cadastro único de linhagens com códigos de linhagem BRM1, BRM2, BRM3, etc. Após o cadastramento da linhagem no sistema, o responsável pela coleção deve registrar tal linhagem como acesso. Por exemplo, após cadastrar a linhagem BRM756, o responsável cadastra o acesso MC25 “amarrado” ao número BRM756.[1]
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*'''Escopo''' – define ente genérico padrão para organização de um conjunto de [[Coleção|coleções]] registrado no [[Sistema AleloMicro]]. Uma vez definido um ''escopo'', é possível vincular um conjunto de regras para o elenco de coleções a ele vinculado, com perfi de acesso diferenciado para cada coleção componente, gestão de registros em base de dados e níveis de responsabilidade de usuário, conforme a [[coleção]] em que esteja cadastrado. Na base de dados do [[Sistema AleloMicro]] destaca-se como exemplo de ''escopo'' as ''Coleções Microbianas da Embrapa'', com mais de treze coleções componentes (2018).
Uma mesma Linhagem pode estar presente em mais de uma Subcoleção. Ex. a mesma linhagem BRM000756 pode estar na Subcoleção A com o código de Acesso YYY e na Subcoleção B com o código de Acesso ZZZ;[2]
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*'''[[Coleção]]''' – organização formal de acervo de germoplasma microbiano, temático, institucional, para a realização de atividades de depósito, conservação, identificação, caracterização e intercâmbio de germoplasma; atua de acordo com protocolos de pesquisa e requisitos de Qualidade. Como exemplo de coleção, apresenta-se a ''Coleção de Recurso Biológico (CRB) de Microrganismos Multifuncionais: Bactérias Diazotróficas e Promotoras de Crescimento Vegetal'', componente do escopo ''Coleções Microbianas da Embrapa'';
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*'''[[Subcoleção]]''' – é uma conjunto organizado e formal componente de determinada coleção temática ou institucional, cujo objetivo é organizar acervo de microrganismo com tipo e finalidade específicos para realização de atividades de pesquisa. A ''Coleção de Invertebrados da Embrapa'', por exemplo, apresenta duas subcoleções: a ''Coleção de Nematóides de Importância Agrícola da Embrapa Clima Temperado'', localizada na unidade da Embrapa, em Pelotas-RS, e a ''Coleção de Nematóides do Gênero Meloidogyne'', em Brasília (DF), na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia;
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*'''Item de [[coleção]]''' (ou acesso)  – linhagem específica componente de determinada [[coleção]];
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*'''[[Linhagem]]'''  – microrganismo em cepa ou isolado disponível em forma de acesso em uma ou mais coleções;
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*'''Amostra de acesso''' ou item de subcoleção – componente físico de germoplasma armazenado em acervo de coleção = criotubo, ampola, etc;
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===Glossário de termos do Sistema AleloMicro | Glossário de términos del Sistema AleloMicro===
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#[[AleloMicro:_Glossário_de_termos_do_sistema | Glossário | Glosario]]
  
 
==Acessar o sistema==
 
==Acessar o sistema==
  
O sistema AleloMicro está baseado na Web, no endereço: http://alelomicro.cenargen.embrapa.br/AleloMicro, e somente pessoas cadastradas podem acessá-lo. As chaves de acesso (login e senha) são elaboradas a partir do Código de Pessoa Física (CPF) do usuário, utilizado como login, e senha inicial fornecida pelo administrador do Sistema, encaminhada para o e-mail do usuário.
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O sistema AleloMicro está baseado na Web, no endereço: https://am.cenargen.embrapa.br/amsistema, e somente pessoas cadastradas podem acessá-lo. As chaves de acesso (login e senha) são elaboradas a partir do Código de Pessoa Física (CPF) do usuário, utilizado como login, e senha inicial fornecida pelo administrador do Sistema, encaminhada para o e-mail do usuário.
  
 
==Alterar senha==
 
==Alterar senha==
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A alteração da senha é importante para segurança dos dados no sistema.
 
A alteração da senha é importante para segurança dos dados no sistema.
 
==Inserir nova linhagem (BRM)==
 
 
# Para inserir nova linhagem, entrar na aba “Linhagem”;
 
 
# selecionar a opção “BRM” (em azul).
 
 
Após lista com as linhagens campo de visão principal da tela apresentará umacadastradas no sistema.
 
 
Na parte inferior da tabela, selecionar a opção “Adicionar”.
 
 
O quadro para inserção de uma nova linhagem aparece.
 
 
Preencher todo o quadro com as informações da linhagem a ser inserida.
 
  
 
==Referências e links externos==
 
==Referências e links externos==
  
 
[[Categoria:Sistema AleloMicro]]
 
[[Categoria:Sistema AleloMicro]]

Edição atual tal como às 16h40min de 31 de outubro de 2022

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Sistema AleloMicro
  1. Menu Administração
  2. Menu Gestão de coleção
  3. Menu Gestão de subcoleção
  4. Menu Intercâmbio
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  8. Menu Linhagens
  9. Menu Subcoleções
  10. Menu Relatórios
  11. Menu Minha conta
  12. Glossário de termos do sistema

O Sistema AleloMicro é um dos sistemas componentes do Plataforma Alelo Recursos Genéticos, plataforma web de recursos e ferramentas de gestão de dados e informações de pesquisa e desenvolvimento da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa). O objetivo do Sistema AleloMicro é fazer a gestão de dados e informações de microrganismos das coleções de referência e de trabalho da Embrapa e instituições parceiras, usuárias do Sistema.

O Sistema AleloMicro foi concebido por equipe multidisciplinar da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, Unidade Descentralizada da Embrapa, com projetos de pesquisa e desenvolvimento voltados à gestão de coleções de microrganismos das mais diversas áreas de interesse: processos produtivos da área agrícola e industrial, produção de energia, meio ambiente, medicina e saúde, entre outros.

Breve histórico

A história das coleções de microrganismos da Embrapa vem sendo construída desde o início da criação da empresa no ano de 1973. A Coleção de Microrganismos de Interesse para a Suinocultura e Avicultura, por exemplo, teve seu primeiro registro oficial, em livro ata de 1977, que à época denominou como “Bacterioteca CNPSu – Embrapa”, cuja finalidade era armazenar amostras de bactérias patogênicas isoladas de amostras clínicas de suínos [1]. Esforços no sentido de organizar essas coleções de microrganismos de forma conjunta vêm sendo conduzidas pela empresa desde 2002, por meio da criação de projetos em rede.

No ano de 2008, a Embrapa constituiu novo projeto de organização com o objetivo de desenvolver uma “plataforma de recursos genéticos” em forma de rede, subdividida em vertentes temáticas da área animal, vegetal e microbiana. No âmbito das coleções microbianas, havia à época aproximadamente 28.000 isolados armazenados na Embrapa, em 20 coleções (incluindo bactérias, fungos, leveduras e vírus) de interesse da pesquisa agropecuária. Neste mesmo ano teve início a criação e desenvolvimento do sistema Infomicro, dedicado à organização e controle das coleções microbianas da Embrapa [2].

A Embrapa tem dedicado esforço na valorização dos ativos conservados na forma de coleção, vem atuando para a organização dessas coleções em projetos de rede com objetivo de sistematizar atividades e processos comuns ao tema. Nesse sentido, a criação do Sistema AleloMicro, em 2011, de maior alcance e capacidade de gestão desse importante ativo de pesquisa, vem ao encontro dessa necessidade de organização dos dados e informações gerados a partir das atividades de conservação, manejo e enriquecimento desenvolvidas no escopo de atuação dessas coleções de microrganismos.

Modelo conceitual

Inicialmente, o AleloMicro adotou conceitos e modelos de representação que expressavam a organização das coleções de microrganismo da Embrapa, mas ao longo de seu desenvolvimento, e diante do avanço dos modelos de desenvolvimento dos sistemas em outras vertentes de gestão de recursos genéticos (animal e vegetal) novos modelos foram incorporados ao seu escopo de desenvolvimento. O esquema a seguir ilustra de modo simplificado a estrutura e os conceitos de Linhagem (microrganismo), de Subcoleção, de acesso ou item de subcoleção (linhagem específica dentro de determinada Subcoleção) e amostra do acesso ou item de subcoleção (componente físico na coleção = criotubo, ampola, etc):

Modelo conceitual de apresentação de coleção, item de coleção, amostra de item de coleção e linhagem[3];

Conceitos de organização e representação do Sistema AleloMicro

  • Escopo – define ente genérico padrão para organização de um conjunto de coleções registrado no Sistema AleloMicro. Uma vez definido um escopo, é possível vincular um conjunto de regras para o elenco de coleções a ele vinculado, com perfi de acesso diferenciado para cada coleção componente, gestão de registros em base de dados e níveis de responsabilidade de usuário, conforme a coleção em que esteja cadastrado. Na base de dados do Sistema AleloMicro destaca-se como exemplo de escopo as Coleções Microbianas da Embrapa, com mais de treze coleções componentes (2018).
  • Coleção – organização formal de acervo de germoplasma microbiano, temático, institucional, para a realização de atividades de depósito, conservação, identificação, caracterização e intercâmbio de germoplasma; atua de acordo com protocolos de pesquisa e requisitos de Qualidade. Como exemplo de coleção, apresenta-se a Coleção de Recurso Biológico (CRB) de Microrganismos Multifuncionais: Bactérias Diazotróficas e Promotoras de Crescimento Vegetal, componente do escopo Coleções Microbianas da Embrapa;
  • Subcoleção – é uma conjunto organizado e formal componente de determinada coleção temática ou institucional, cujo objetivo é organizar acervo de microrganismo com tipo e finalidade específicos para realização de atividades de pesquisa. A Coleção de Invertebrados da Embrapa, por exemplo, apresenta duas subcoleções: a Coleção de Nematóides de Importância Agrícola da Embrapa Clima Temperado, localizada na unidade da Embrapa, em Pelotas-RS, e a Coleção de Nematóides do Gênero Meloidogyne, em Brasília (DF), na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia;
  • Item de coleção (ou acesso) – linhagem específica componente de determinada coleção;
  • Linhagem – microrganismo em cepa ou isolado disponível em forma de acesso em uma ou mais coleções;
  • Amostra de acesso ou item de subcoleção – componente físico de germoplasma armazenado em acervo de coleção = criotubo, ampola, etc;

Glossário de termos do Sistema AleloMicro | Glossário de términos del Sistema AleloMicro

  1. Glossário | Glosario

Acessar o sistema

O sistema AleloMicro está baseado na Web, no endereço: https://am.cenargen.embrapa.br/amsistema, e somente pessoas cadastradas podem acessá-lo. As chaves de acesso (login e senha) são elaboradas a partir do Código de Pessoa Física (CPF) do usuário, utilizado como login, e senha inicial fornecida pelo administrador do Sistema, encaminhada para o e-mail do usuário.

Alterar senha

  1. Após entrar no sistema, acessar a aba “Minha Conta”;
  2. selecionar a opção “Minha Conta” e entrar na opção “Alterar Senha”.
  3. Preencher o quadro com a senha enviada pelo administrador;
  4. colocar a nova senha no campo indicado e no campo confirmação;
  5. Clicar no botão “alterar”.

A alteração da senha é importante para segurança dos dados no sistema.

Referências e links externos

  1. Projeto REGEN_06_19_ Conservação de Coleções de Microrganismos da Embrapa; No. 10.20.02.009.00.00; Sistema Quaesta: Projeto Tipo I (Pesquisa e Desenvolvimento); Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária; Brasília-DF, 1/5/2021;
  2. INFOMICRO: Sistema de informações de coleções de microrganismos da Embrapa; MELO L. A. M. P., LOPES, R. B.; TIGANO, M S.; HIRAGI, G. O.; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Brasília-DF, 1/5/2011.
  3. Manual de gestão da coleção de bactérias de invertebrados: Instrução Técnica de Uso de Sistema AleloMicro para Coleções Microbianas. Núcleo de Gestão da Qualidade (NGQ), Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Brasília-DF; 2015.