Mudanças entre as edições de "AleloMicro-SiBBR: dicionário de dados"

Edição das 18h24min de 18 de novembro de 2020

A Plataforma Alelo Recursos Genéticos, da qual faz parte o Sistema AleloMicro, participa de projetos e iniciativas de compartilhamento de dados e informações de recursos genéticos de microrganismos em favor da valorização dos acervos e da atividade de conservação de recursos genéticos com objetivo de promover o desenvolvimento da pesquisa voltada a alimentação e agricultura. A integração das bases de dados do Sistema AleloMicro com o sistema SiBBr foi constituída a partir da ferramenta IPT (Integrated Publishing Toolkit) para estrutruração de conjunto de dados definidos a partir do reconhecimento dos padrões admitidos no desenho de informações do sistema Darwin Core. A documentação a seguir apresenta o dicionário de conversão de tabela de dados de ambos os sistemas.

nme_escopo

nme_instituicao

nme_colecao

subcolecao

SELECT 'Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia' 
    AS nme_instituicao, nme_colecao, sgl_subcolecao || '-' || 
    nme_subcolecao AS subcolecao, sgl_escopo || ' ' || 
    LPAD(CAST(idt_linhagem AS VARCHAR), 6, '0') || '/' ||  pfx_subcolecao || ' ' ||

brm

codigo_subcolecao

familia

genero

especie

subcategoria_taxonomia

hosp_familia

hosp_genero

hosp_especie

hosp_subcategoria

codigos_outras_instituicoes

nome_pais

nome_estado

nome_municipio

altitude

latitude

longitude

substrato

bioma_brasileiro

categoria_linhagem

metodo_identificacao

metodo_isolamento

meio_cultura_isolamento

coletores

identificadores

isoladores

Referências

@@ Linha 13: / Linha 13: @@
       AS nme_instituicao, nme_colecao, sgl_subcolecao || '-' ||
       nme_subcolecao AS subcolecao, sgl_escopo || ' ' ||
       LPAD(CAST(idt_linhagem AS VARCHAR), 6, '0') || '/' ||  pfx_subcolecao || ' ' ||
- CAST(num_subcolecao AS VARCHAR) AS numero_catalogo,
-     'BRA/' || sgl_subcolecao || '/' || sgl_escopo || ' ' ||
- LPAD(CAST(idt_linhagem AS VARCHAR), 6, '0') || '/' ||
-     pfx_subcolecao || ' ' || CAST(num_subcolecao AS VARCHAR)
- AS idt_ocorrencia, 'PreservedSpecimen' as basisofrecord,
 ===brm===