Mudanças entre as edições de "AleloVegetal: Tutorial migração assistida de dados"

Edição das 11h18min de 4 de junho de 2018

Migração assistida de dados é o termo usado para denominar a atividade realizada pela equipe de desenvolvimento do Portal Alelo Recursos Genéticos para o reconhecimento, avaliação e importação de planilhas e outros meios de organização de dados e informações de recursos genéticos de modo que possam formar a base de dados das coleções e bancos de germoplasma no Sistema Alelo. Uma dos principais objetivos da atividade é evitar duplicatas e inconsistência de dados no sistema. Geralmente as informações em forma de planilha são usadas por pesquisadores e profissionais de coleções e bancos de germoplasma para a gestão de acervo de recursos genéticos.

Etapas da migração de dados

A atividade da equipe Alelo consiste em receber as informações do Curador em seu formato original, conforme sua própria organização, e prepará-la para envio à base de dados do sistema Alelo. Algumas etapas são importante até que as informações sejam migradas para a base de dados do Alelo: primeiramente, após o recebimento dos dados, é feita uma primeira avaliação pela equipe de desenvolvimento na qual dúvidas e possíveis inconsistências, como duplicação ou ausências de dados obrigatórios, são verificadas diretamente com o Curador. Numa segunda etapa os dados e informações são padronizados e enviados para uma base de dados provisória, para uma nova conferência. Somente após esta última avaliação, os dados são considerados aptos a compor a base de dados do do sistema Alelo, conforme as orientações de restrição definidas pelo Curador, que passa a assumir a gestão das informações.

Importante destacar que para o melhor uso das funcionalidades do Sistema Alelo, a Migração assistida de dados ocorra antes do treinamento dos profissionais no uso da ferramenta, de modo que possam reconhecer suas informações dentro do sistema ao mesmo tempo fazer o uso da funções de gestão disponíveis em seu ambiente. A primeira carga de informações de uma coleção ou banco de germoplasma no Sistema Alelo pode ser feita com os dados básicos que o Curador disponha. É importante porém que estejam em formato digital. Caso ainda não possua os dados digitalizados, recomenda-se que sejam feitos em forma de planilha.

Migração de dados no sistema AleloVegetal

Dados de Passaporte

São considerados dados obrigatórios de Passaporte:

1. Código local
2. Nome científico
3. Data de entrada no BAG/Coleção
4. Forma de obtenção
5. Código BRA (gerado automaticamente pelo Alelo)

Outros dados importantes

1. Status biológico
2. Nome comum (*)
3. Instituição de procedência
4. Local de procedência
5. Data de introdução
6. Forma de conservação (*)
7. Data de obtenção
8. Local de obtenção
9. Código do coletor
10. Latitude
11. Longitude
12. Altitude

• Observação: para preparo de planilhas, em caso de haver mais de um valor para o mesmo tipo de informação, pode ser inserido uma coluna para cada valor.

O Curador pode informar os dados que tenha disponível, na melhor organização possível. Um acervo mais antigo, por exemplo, pode não possuir dados de georreferenciamento. Nesse casos os dados de município, onde ocorreu a coleta, podem suprir e apoiar futuras consultas. Dados de taxonomia, localidades e instituições, por exemplo, passam por revisão e conferência de informações antes de serem validadas em sistema.

Dados de observação

As informações de observação são alimentadas no sistema na forma de metadados, necessários ao recebimento de resultados de ensaios promovidos pelo BAG. O Curador deve ter em mãos a definição dos descritores de sua coleção, em arquivo eletrônico. Para dados de ensaio de BAG ou coleção, a equipe Alelo está disponível para apoiar a migração inicial das informações. Uma vez no Alelo, dados e informações passam a ser controlados pelo próprio Curador, no sistema, incluindo as restrições e disponibilidades na web.

Dados de conservação

O sistema AleloVegetal permite o mapeamento de endereço de localização do acervo de coleção ou BAG. O modelo pode ser usado desde o “endereçamento” florestas, com apoio dos dados de georreferenciamento, como também para localizar o acesso em câmaras frias. por exemplo: Câmara > Corredor > Prateleira > Caixa > Linha > Coluna.

Para simplificar a carga inicial de dados de uma coleção, o Curador deve ter em mãos a definição da estrutura de armazenamento dos acessos organizada por níveis de hierarquia. Além da forma de endereçamento de conservação, indicadores como poder germinativo, umidade, frequência de poda, entre outros, podem ser registrados e controlados pelo próprio Curador no sistema Alelo.

Prazo de migração de dados

O tempo necessário à migração de dados para o sistema Alelo depende da qualidade e quantidade de dados enviado pelo Curador. O prazo médio é de 15 dias e depende da demanda existente à época do envio da planilha e da qualidade dos dados constantes no arquivo. No final do ano por exemplo, quando se faz importante para curadores a produção de relatórios de resultados, é comum haver uma grande quantidade de demandas para o setor.

Envio de informações

O envio de planilhas e documentos pode ser feito por meio dos e-mails: cenargen.nti@embrapa.br; gilberto.hiragi@embrapa.br (Supervisor do NTI); renato.sales@embrapa.br (Desenvolvedor)

O Curador deve informar no e-mail:

• nome do BAG/Coleção;
• breve descritivo do conteúdo enviado;
• nome do Curador; e
• nome dos Empregados para gestão dos dados no Alelo.